Η Πράγα εξακολουθεί να διατηρεί την ιστορική της σύνδεση με την αλχημεία, προσφέροντας στους επισκέπτες την ευκαιρία να εξερευνήσουν αυτήν την συναρπαστική ψευδοεπιστημονική πτυχή του παρελθόντος της. Αν και η αλχημεία θεωρείται σήμερα ψευδοεπιστήμη, στον Μεσαίωνα ήταν μια σοβαρή προσπάθεια κατανόησης του κόσμου, με επίκεντρο την μετατροπή μετάλλων και την αναζήτηση της φιλοσοφικής λίθου, που γοήτευε ακόμη και αυτοκράτορες. Οι αλχημιστές ήταν ευπρόσδεκτοι στην Πράγα του 16ου αιώνα επειδή η αλχημεία θεωρούταν μια σεβαστή επιστήμη. Ο Ροδόλφος Β΄ (1552-1612) Αυτοκράτορας της Αγίας Ρωμαϊκής Αυτοκρατορίας είχε εμμονή με την αλχημεία και την αναζήτηση της Φιλοσοφικής Λίθου, αυτής της μυστηριώδους ουσίας που όχι μόνο θα μετέτρεπε τα βασικά μέταλλα σε χρυσό, αλλά θα ήταν και ένα ελιξίριο ζωής, που θα του χάριζε αθανασία, αιώνια νεότητα και θα θεράπευε όλες τις ασθένειες. Μάλιστα ο Ροδόλφος είχε χτίσει μεγάλα εργαστήρια στο Κάστρο της Πράγας...