Η ακριβής διάγνωση της αιτίας του πόνου στα γεννητικά όργανα ή την πυελική χώρα γενικότερα αναδεικνύεται σε πρόκληση για τους γυναικολόγους, καθώς σπανίως ο πόνος οφείλεται σε μία μεμονωμένη πάθηση. Μπορεί να συνυπάρχουν δύο ή και περισσότερες παθήσεις που έχουν σαν αποτέλεσμα τη δυσφορία που βιώνει η γυναίκα. Ακόμη κι αν αντιμετωπιστεί μία από τις υποκείμενες αιτίες του προβλήματος, ο πόνος μπορεί να επιμείνει. Οι πέντε βασικότερες αιτίες του πόνου στα γυναικεία γεννητικά όργανα είναι οι εξής: 1. Ενδομητρίωση Εμφανίζεται όταν κύτταρα όμοια με αυτά του τοιχώματος ιστού της μήτρας μεταναστεύουν εκτός της μήτρας. Βασικά συμπτώματα είναι οι κοιλιακές κράμπες, οι οποίες συχνά συμπίπτουν με την έμμηνο ρύση. Ο πόνος συχνά ακτινοβολεί στα μέση και τα πόδια. Η διάγνωση γίνεται λαπαροσκοπικά, με τη βοήθεια βιοψίας. Αντιμετωπίζεται συνήθως με μη στεροειδή αντιφλεγμονώδη σε συνδυασμό με αντισυλληπτικά ώστε να συρρικνωθεί ο ιστός του ενδομητρίου.